二居神社（ふたいじんじゃ）は，JR（上越本線）越後湯沢駅の南，約10キロメートルの二居地区に鎮座する。
「神社明細帳」に「南魚沼郡二居村字十二ノ木 無格社・十二神社」とある。
大山祇命を祭神とする十二神社で，旧二居村の産土神である。
二居地区には，諏訪神社（健御名方神）と天王神社（素盞嗚尊）も鎮座したが，昭和三十六年（1961）の台風で倒壊したため当社に合併となった。
昭和四十三年（1968），「十二神社」を現社号に改めた。
最初の鳥居を過ぎると参道が左（北）に折れ，二の鳥居とその先の石段が見える。
