奴奈川神社は，梶屋敷駅（日本海ひすいライン）の西200メートルに鎮座する。
社伝による当社の由緒は以下のとおり。
高皇産霊尊（タカミムスヒ）の子・意支都久辰為命（オキツクシイ）が高志国に降臨し，その子の俾都久辰為命（ヘツクシイ）とその子の奴奈川姫命がこの地を治めていたが，八千矛神（大国主）が来て，ともに国造りし，それが終わるや多布勢（たぶせ）の神沼山に岩隠れした。
その後，成務天皇の時，市入命（イチイリ）が越の国造として来たり，奴奈川姫の社を建てて祭ったという。
現在の祭神は奴奈川姫命で，相殿に大日霊命（オオヒルメ）と八千矛神を祭る。
当社は『延喜式』の「奴奈川神社」（頸城十三座の一）の論社である。当社のほか一の宮の奴奈川神社，能生の白山神社も「式内・奴奈川神社」の候補である。
拝殿屋根の紋は「榊九葉」という。
拝殿の裏に本殿が建っている。流造りの屋根が見え，下部は覆われている。