藤戸社は，JR新発田駅の北東5キロメートルに鎮座する。櫛形山脈の南端，要害山の麓に朱の鳥居が見える。
（要害山は，鎌倉時代初頭の越後守護兼加治荘地頭・佐々木盛綱が築城した山として知られる。）
「神社明細帳」（明治二十年）に「北蒲原郡東宮内村字藤山 村社・藤戸社」とある。
『菅谿史跡』なる文献が，藤戸神社を「延喜式」所載の「美久理神社」（沼垂郡五座の一）に比定しているという。（また新潟市沼垂東の白山神社，あるいは二王子神社を美久理神社とする説もある。）
「明細帳」は，建久年間（1190-98）佐々木盛綱が勲功によって当地の地頭に任ぜられ，要害山に大祖の宇多天皇を祭り「藤戸神社」と号したとする。それが正しいとすると，鎌倉期の創立ということになり，式内社ではない。
祭神は宇多天皇と大己貴命である。明治四十一年，字神明山の神明社（天照皇大神）を合併した。
「明細帳」は境内社として石動社を記録している。
社殿までは急峻な長い石段が続く。両脇は杉の古木が並ぶ。（境内にはヘビが多いので注意。）
