貴船神社（きふねじんじゃ）は，叡山電車（鞍馬線）貴船口駅の北1.8キロメートル，鞍馬山と貴船山の間を流れる貴船川の右岸に鎮座する。
貴船川は，当社の南南西4.5キロメートルで鴨川に合流する。平安京にとって重要な水源のひとつであり，当社の起源は水神への信仰であろう。
『延喜式』（神名帳）所載の「貴布禰神社」（愛宕郡二十一座の一）で，社格は名神大社である。
初めの鎮座地は，本宮から800メートルほど上流の奥宮の場所であったが，永承元年（1046）の水災で社殿が流出し，天喜三年（1055），現在地に再建されたという。
その後，賀茂別雷神社（上賀茂神社）の支配下となり，たびたび独立を画したが果たせず，明治四年（1871）に官幣中社となってようやく独立した。
現在の祭神は高龗神（たかおかみのかみ）である。
